医院污水净化处理主要去除污染物:无机物、有机物、致病菌和病毒，重属废水、低放射性废水等。
1)无机污染物:泥砂、以及一些医疗辅材等。
2)有机污染物:粪便、卫生纸、动植物油以及一些医疗废弃物等。
3)致病物质:各类致病菌和病毒、有毒有害医疗废弃物质等。
具体处理工艺技术
1)无机污染物处理:
采用物理分离加以去除方法:格栅、初沉池加分离处理去除污染物。
2)有机污染物处理技术
有机污染物处理主要采用生物处理工艺。
3)生物处理技术工艺经济性
到目前为止还没有那一种处理方法比生物降解法更有效廉价，不管物理方法、化学方法以及贰者联合处理方法，都不能优于生物降解法性价比。生物降解法在处理各类有机废水工程中己发辉了具大效益，并被广泛采用，该工程虽小在设计中也将无以例外采用生物降解法净化废水中有机污染物。
5. 生物降解处理工艺
分厌氧、兼氧、好氧等工艺技术，视水体污染物浓度和处理要求可单采用其中一种或两种以上联合处理，那种工艺技术方法更经济就采用那一种， 具体情况视工程需要而定。
6.厌氧工艺
厌氧工艺有化粪池、ABR、UASB、USB、IC等工艺技术，化粪池应用广泛，UASB、USB、IC、BAF等工艺技术，由技术性强只在高浓度废水处理应用较多，只有ABR工艺技术控制难点较少，在中低浓度度废水处理应用较广泛，在实际工程实施中取得了良好效果。
7.好氧工艺
好氧工艺有:活性污泥法、氧化沟、SBR、A/O、A2/O、接触氧化法、BAF以及二者混合等处理工艺技术。氧化沟、SBR等工艺，技术性强适合中大型工程采用。
A/O、A2/O等工艺，A/O工艺简单，对有机污染物去除率85-95%，不采取后续措施就能达GB18466-2005《医疗机水污染排放标准》排放标准大部分污染物控制指标；A2/O和BAF工艺较复杂，技术性强、操控较难，但对机污染物去除率在90-98%，并具有脱氮功能；接触氧化法工艺简单，技术性强，操控容易、稳定，对水体中有机污染物去除率90-95%，通过运转过程调整，具有一定脱氮功能。
8.消毒处理工艺
采用传统氯化法消毒灭菌，药剂采用消毒效果好的次氯酸钠为消毒剂。
9.有机含致病污泥处理
医院污水处理过程，化粪池、栅渣、生化处理过程等泥渣经无害化处理后送固废中心处置。
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