1.现代化农业生产带来的污水污染
目前，养殖废弃物的任意排放。农村养殖是环境污染的主要污染源点，造成水质变坏、影响土壤的酸碱性、大气浑浊恶臭，直接影响农业产品的品质，水的性质。危害农业生产，且易传染疾病，影响居民健康。
中国自古以来就有家庭养 殖的传统广大农村几乎家家圈里有猪，院里有鸡。近年来中国养殖业发展很快。规模不等的养殖场遍地开花，但也存在汗多问题。如饲料生产监管不严，滥加添加 剂。大多数农民环保意识差，缺乏维权意识和基本的污水处理技术。散户养殖比重大：养殖户为节约成本对粪便，污水几乎不做任何处理就直接排放到农田或水体或 露天堆放，造成土壤，地下水的污染。且井的选址与厕所，猪圈，堆粪地相距较近。因此，农村养殖对污水排放对农村饮用水源造成了严重的污染。
2.农村养殖业废水污染严重
种植业废弃物（秸秆）和养殖业废弃物（畜禽粪便）是农业废弃物的两个主要来源。农村畜禽养殖多为无序分散状况，且数量较多，大量畜禽粪尿未经处理就直接 排放，造成当地环境（特别是地下水）污染，现已成为农村一大新的污染源。集约化养殖场其污染危害更加严重，畜禽粪便对地表水造成有机污染和富营养化污染， 对大气造恶臭污染，甚至对地下水造成污染，其中所含病原体也对人群健康造成了大威胁。养殖污水长时间渗入地下使地下水中的硝态氮浓度增高，地下水溶解氧 含量减少，有毒成分增多，导致水质恶化，甚至丧失其使用功能，同时危及周边生活用水水质。高浓度污水还可以导致土壤孔隙堵塞，造成土壤透气透水性下降及板 结，盐化严重降低土壤质量，甚至伤害农作物，造成减产和死亡。
3.禽畜养殖对土壤重金属的污染
重金属元素不像有机物污染能被土壤 中的微收集整理生物降解，将留置在土壤中，导致其含量不断在土壤中增加，从而破环土壤中微生物群落和游离酶活性。研究发现，使用中高量猪厩肥会明 显提高稻田地土壤中的zn，cu生物有效性，其效态含量分别比对照组增加86.5%，66.8%和42.3%。as总量明显增高。而效态含量增加不明显。 可能是饲料中AS含量虽高，土壤中点位低。尤其值得注意的是，在我国农村现代化进程较快的地区，这种基础设施建设和环境管理落后于经济和城镇化发展水平的现象并没有随着经济水平的提高而改善，其对人群健康的威胁正在与日俱增。
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